Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F3

PCDHB1, Protocadherin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB1Q9Y5F3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB1Q9Y5F3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB1Q9Y5F3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB1Q9Y5F3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB1Q9Y5F3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB1Q9Y5F3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB1Q9Y5F3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB1Q9Y5F3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB1Q9Y5F3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB1Q9Y5F3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB1Q9Y5F3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms