Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBEC2Q9Y235 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms