Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNB3Q9ULL4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNB3Q9ULL4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 711.9 ms