Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF346Q9UL40 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF346Q9UL40 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms