Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAE1Q9UBE0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms