Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGPEP1Q9NXJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGPEP1Q9NXJ5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms