Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SDHAF3Q9NRP4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDHAF3Q9NRP4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms