Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DNAJC4Q9NNZ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms