Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3GQ9HC16 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms