Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRDE2Q9H7Z3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms