Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMYD3Q9H7B4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms