Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4G0

EPB41L1, Band 4.1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L1Q9H4G0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB41L1Q9H4G0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB41L1Q9H4G0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms