Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRN3Q9H3W5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRN3Q9H3W5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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