Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUSAP1Q9BXS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUSAP1Q9BXS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms