Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HIGD2AQ9BW72 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms