Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD7Q9BUK0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHCHD7Q9BUK0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms