Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPON2Q9BUD6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPON2Q9BUD6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms