Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms