Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP2Q9BRK0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP2Q9BRK0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms