Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LPIN3Q9BQK8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LPIN3Q9BQK8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms