Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX50Q9BQ39 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX50Q9BQ39 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms