Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms