Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGMNQ99538 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms