Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPXM1Q96SM3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CPXM1Q96SM3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPXM1Q96SM3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms