Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOX2Q96NM4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOX2Q96NM4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOX2Q96NM4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOX2Q96NM4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOX2Q96NM4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOX2Q96NM4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOX2Q96NM4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOX2Q96NM4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TOX2Q96NM4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOX2Q96NM4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms