Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIGD1Q96MW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIGD1Q96MW7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD1Q96MW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD1Q96MW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD1Q96MW7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD1Q96MW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD1Q96MW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD1Q96MW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD1Q96MW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TIGD1Q96MW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIGD1Q96MW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms