Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC138Q96M89 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC138Q96M89 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms