Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf90Q96M02 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C10orf90Q96M02 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C10orf90Q96M02 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C10orf90Q96M02 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C10orf90Q96M02 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C10orf90Q96M02 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C10orf90Q96M02 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms