Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMX3Q96JJ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMX3Q96JJ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms