Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM46AQ96IP4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM46AQ96IP4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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