Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms