Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP36Q96EU6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP36Q96EU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms