Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD3Q96ES6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MFSD3Q96ES6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms