Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCC1Q96CN9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms