Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DHX58Q96C10 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX58Q96C10 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms