Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms