Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE2Q8WWL2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIRE2Q8WWL2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIRE2Q8WWL2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIRE2Q8WWL2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIRE2Q8WWL2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms