Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms