Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
WHAMMQ8TF30 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WHAMMQ8TF30 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms