Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC57Q8N9N7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC57Q8N9N7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms