Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC89Q8N998 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC89Q8N998 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms