Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms