Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms