Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC50Q8IVM0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC50Q8IVM0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms