Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD3Q86UT5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD3Q86UT5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms