Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APTXQ7Z2E3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APTXQ7Z2E3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms