Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms