Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRADAQ7RTN6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms