Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCQ7LC44 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms