Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHMP1BQ7LBR1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHMP1BQ7LBR1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms